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l'Unité de biopsie liquide
Une initiative du Programme de recherche sur le cancer du RI-CUSM
L'Unité de biopsie liquide (UBL) est une unité de recherche translationnelle collaborative dont l'objectif est d'accélérer la découverte, la validation et la mise en œuvre de biomarqueurs cancéreux à base d'acides nucléiques libres circulants (ADNlc/ARN) dans les flux de travail cliniques
CE QUE NOUS OFFRONS
Nous soutenons les projets de biopsie liquide
tout au long de leur cycle de vie
Idéation de projets et remue-méninges
Soutien à la rédaction de demandes de subvention, révision, lettres d'appui et CÉR
Développement et dépannage de dosages, incluant l'isolation et le contrôle qualité de l'ADNlc, la SNG et la ddPCR
Accès à une biobanque d'échantillons cliniques
Nous utilisons nos systèmes validés
Nous disposons d'un répertoire de procédures opératoires normalisées (PON) et de dosages.
Ils permettent :
- Sélection des réactifs pour la quantification de l'ADNct par ddPCR
- Extraction d'ADN acellulaire (manuelle ou automatisée)
- Contrôle qualité des acides nucléiques extraits (% d'ADNlc par rapport à l'ADN génomique)
- Dosages de validation ddPCR (LdB/LdD/LdQ)
- Préparation de bibliothèques d'ADNlc (ciblée et SGE)
- Analyses des mutations de l'ADNct et signatures fragmentomiques
Notre banque de réactifs amorces/sondes/gBlock permet de détecter plus de 90 variants nucléotidiques simples (VNS) dans plus de 50 gènes liés au cancer et plus de 25 gènes viraux.
Nous résolvons les problèmes de développement de dosages
Notre ressource de dépannage aide à surmonter les défis liés aux dosages ddPCR :
- Réactivité croisée des sondes
- Sonde à faible séparation avec signal négatif de base
- Dosage multiplex (basé sur l'amplitude) — cibles avec amplitudes de base variables
- Dosage multiplex (basé sur l'amplitude) — séparation insuffisante entre les amplitudes cibles
- Dosage multiplex (basé sur le canal) — réactivité croisée du signal cible
- Contamination dans les puits NTC
Nous aidons dans tous les types de cancer
L'UBL a développé plusieurs partenariats clés avec des fournisseurs et des prestataires de services,
permettant des tarifs réduits sur les réactifs et consommables, ainsi que des délais d'exécution plus rapides.
Comparaison des méthodes bronchoscopiques basées sur la biopsie liquide aux méthodes traditionnelles de l'ADNct chez des patients suspects de cancer du poumon non à petites cellules métastatique
Surveillance de l'ADNlc et de l'ADNct chez des patients pancréatiques inscrits à un programme de préréhabilitation pour évaluer la charge de morbidité, les résultats de survie et la qualité de vie liée à la santé
Profilage du microbiome, de la diversité des cellules immunitaires et des lipides chez des patients atteints de cancer de la prostate
Détecter la récidive précoce du mélanome en développant un nouveau test sanguin pour suivre le succès du traitement
QUI EST DERRIÈRE L'UNITÉ
Rencontrez l'équipe
Julia Burnier, Ph. D.
Directrice
Julia dirige l'orientation de l'UBL. Elle a obtenu un doctorat en biologie moléculaire et cellulaire à l'Université McGill, axé sur les mécanismes moléculaires de l'invasion et de la métastase du cancer. Elle a ensuite effectué une formation postdoctorale à McGill et au Centre de régulation génomique à Barcelone. Ses travaux ultérieurs ont porté sur la génomique du cancer dans des essais cliniques à l'Hôpital Princess Margaret à Toronto. En 2018, elle a lancé un programme de recherche indépendant au sein du Programme de recherche sur le cancer du RI-CUSM pour étudier les molécules circulantes dérivées des tumeurs dans la progression et la métastase du cancer. Sa recherche utilise des biopsies liquides et des modèles cellulaires pour développer des biomarqueurs sensibles et des thérapies ciblées en étudiant les acides nucléiques circulants et les vésicules extracellulaires qui reprogramment le microenvironnement tumoral.
Shivshankari Rajkumar, Ph. D.
Gestionnaire
Shivsha gère les opérations scientifiques de l'UBL. Avant de rejoindre l'UBL, elle était scientifique principale de recherche dans une startup de biotechnologie montréalaise développant des technologies de détection et de diagnostic au point de besoin et au point de soin, où elle dirigeait des projets de recherche, obtenait des financements et formait de jeunes scientifiques. Dans ce rôle, elle a également développé une méthode novatrice, évaluée par des tiers, pour le traitement d'échantillons de mollusques et la quantification des biotoxines marines. Shivsha est biochimiste avec plus de sept ans d'expérience en biologie moléculaire, biologie du cancer et recherche translationnelle. Ses recherches doctorales à l'Université McGill ont permis d'identifier une stratégie thérapeutique approuvée par la FDA avec une application potentielle pour les patients atteints de mélanome porteurs de mutations coexistantes d'oncogènes et de suppresseurs de tumeurs.
Deux comités soutiennent l'Unité
En collaborant avec nous, vous bénéficiez de la force de scientifiques experts qui alignent nos initiatives avec diverses priorités de recherche.
Groupe de travail
Un groupe interdisciplinaire de base de scientifiques fondamentaux et cliniciens possédant une vaste expertise incluant la génomique fonctionnelle, la découverte de biomarqueurs et la médecine de précision. Ce groupe a été créé pour favoriser le remue-méninges de base sur les projets collaboratifs en cours, partager des idées sur la conception de projets et les flux de travail efficaces, et planifier un financement durable.
Annie Leung, MD
Ian Watson, PhD
Patricia Tonin, PhD
Nader Sadeghi, MD
Joanna Przybyl, PhD
Consortium consultatif de recherche
Un consortium de plus de 25 chercheurs, cliniciens et membres de la haute direction du RI-CUSM et d'autres instituts aide à guider l'orientation stratégique de l'UBL, à assurer une large participation des groupes de recherche et à intégrer diverses priorités de recherche. Ce consortium se tient au courant des projets collaboratifs actuels et de leur impact, développe des stratégies pour accélérer la recherche sur la biopsie liquide au sein du PRC et au-delà, et identifie des occasions d'intégrer les flux de travail à l'échelle du RI-CUSM.
Patricia Tonin, PhD
Joanna Przybyl, PhD
Nader Sadeghi, MD
Annie Leung, MD
Ramy Saleh, MD, MSc, FRCPC
Antonio Vigano, MD, MSc
Louise Pilote, MD, MPH, PhD
Sushmita Pamidi, MD
David Buckeridge, MD, PhD
Angela Genge, BSc, MD, FRCPC
Ciriaco Piccirillo, PhD
Donald Van Meyel, PhD
Annette Majnemer, OT, MSc, PhD
Simone Chevalier, PhD
Xing Zeng, MD
Victoria Mandilaras, MD
Andrew Zakhari, MD, FRCSC, MGSC
Fadi Brimo, MD
Tarek Hijal MD, CM, MSc, FRCPC
Sarkis Meterissian, MD, MSc, FRCS, FACS
Mariane Bertagnolli, PhD
Ian Watson, PhD
John Stagg, PhD
Simon F Roy, MD, MHS
Ioannis Ragoussis, PhD
Yasser Riazalhousseini, PhD
Mark Basik, MD, CM
Anne-Marie Mes-Masson, PhD, FCAHS, FRSC
Lili-Naz Hazradi, MD, PhD, FRCPC
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Nous pouvons vous aider à accélérer vos projets existants, ou vous aider à démarrer votre premier projet de biopsie liquide.
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